YASS (программа тәэминаты)

YASS (Yet Another Similarity Searcher, тәрҗемәсе - Тагын Бер Охшашлык Эзләүче)^[1]^[2] ул ирекле программа тәэминаты,^[3] нуклеотид дәвамлылыклары өчен пар-пар дәвамлылык тигезләү программа тәэминаты, ягъни, ул ДНК һәм РНК дәвамлылыклары арасында охшашлыклар эзли. YASS нуклеотид дәвамлылыкларын йә гади форматта, йә FASTA форматында кабул итә һәм нәтиҗә форматта BLAST табуляр нәтиҗәсе бар. YASS-та берничә күчеш чикләнгән аралы орлык k-мерлар бар, алар танырлык камилләштерелгән сиземлекне рөхсәт итәләр. YASS локаль рәвештә кулланучы машинасында яки SaaS (Интернетта эшли торган программа) буларак YASS web server-да кулланылырга мөмкин, ул браузерга нигезләнгән дот-плот барлыкка китерә.

Шулай ук карарга мөмкин

Искәрмәләр

↑ Noe L., Kucherov. G. (2005). «YASS: enhancing the sensitivity of DNA similarity search». Nucleic Acids Research 33 (2): W540–W543. DOI:10.1093/nar/gki478. PMID 15980530.
↑ Noe L., Kucherov. G. (2004). «Improved hit criteria for DNA local alignment». BMC Bioinformatics 5: 149. DOI:10.1186/1471-2105-5-149. PMID 15485572.
↑ README.

Тышкы сылтамалар

Official website

[NoeKucherov2005-1] Noe L., Kucherov. G. (2005). «YASS: enhancing the sensitivity of DNA similarity search». Nucleic Acids Research 33 (2): W540–W543. DOI:10.1093/nar/gki478. PMID 15980530.

[NoeKucherov2004-2] Noe L., Kucherov. G. (2004). «Improved hit criteria for DNA local alignment». BMC Bioinformatics 5: 149. DOI:10.1186/1471-2105-5-149. PMID 15485572.

[3] README.

[1]

[2]

[3]